МАОУ НОШ № 53 находится в Центральном районе города Калининграда, в поселке им. героя Советского Союза Александра Космодемьянского.
Начальная школа № 53 открыта в 1997 - 1998 учебном году на основании приказа Управления образования мэрии города Калининграда за № 597 от 16 сентября 1997 года. Приказ издан в соответствии с Законом Российской Федерации «Об образовании» в редакции 13.01.96. и распоряжения Мэра города Калининграда № 301- Р от 4 июня 1993 года о порядке регистрации образовательных учреждений.
7 ноября 2011 года муниципальное автономное общеобразовательное учреждение начальная общеобразовательная школа № 53 создано путем изменения типа существующего муниципального общеобразовательного учреждения начальной общеобразовательной школы № 53.
Первым директором школы была Родионова Валентина Антоновна.
С 23.08.2007 г. - директор Малюгина Антонина Петровна, Почётный работник общего образования.
Учредителем является Комитет по образованию Администрация городского округа "Город Калининград".
В учебном заведении сложился профессиональный, компетентный и работоспособный педагогический коллектив.